不过，随着玄武湖的污染，此种鱼早已绝迹了。玄武湖中的绿洲也被辟为黄册府，保存全国的档案。清代玄武湖再度繁盛，因为湖中的水产。当时玄武湖的荷叶供应全城使用，政府甚至颁布了荷叶专卖令，命令全市使用的荷叶只能使用玄武湖中所产。樱洲的樱桃、湖中的水产供应全城使用，城北台城一侧的长堤上依旧密植杨柳。民国时期，玄武湖被辟为“五洲公园”，再次成为南京的名胜。
玄武湖是我们南京最著名的景点之一，玄武湖的兴亡废替也与南京的命运息息相关。
玄武湖原本名叫桑泊，宋武帝刘裕时改名为玄武湖，之所以有此名，是传说有人看到湖中黑龙出现。（玄武湖中的黑龙，有人认为可能是玄武湖中曾经的特产——一种黑色鲫鱼，据说肉质鲜美，但游动的速度极快，每天仅在傍晚穿湖而过，因此极难钓到。不过，随着玄武湖的污染，此种鱼早已绝迹了。）不过也有专家认为，刘裕之所以给湖取名玄武，是为了完成都城的“四神”格局。古代人以北极星为核心，将夜空分为四个部分，按照其形状分别以四种神兽命名：东方青龙，西方白虎，北方玄武，南方朱雀。古人强调天人合一，皇帝既然是天子，所居之地也应当有这样的四神格局。南京钟山龙蟠、石城虎踞、南方秦淮河上又有朱雀航，因此皇帝将背面的桑泊命名为玄武湖也就不难理解了。据说，刘裕还在湖中建三座小岛，对应传说中的蓬莱、方丈、瀛洲三座仙山，就是今天梁洲、翠洲和环洲的前身（此说不准确，后将详述）。
玄武指的是一种龟蛇合体的神兽，本是水神，而南朝水师是其军队最重要的组成部分之一，玄武湖在南朝自然也就成了水军的一个重要的演习场所。当时玄武湖直通长江，南朝北伐时的水师常常在湖中集结，然后驶入长江，经邗沟向北进发。因此，玄武湖边的一些小山，如九华山，当时也是重要的军事基地。但在大多数时间内，玄武湖是南朝帝王们的游乐之处。其时，玄武湖侧有青山环抱，满眼青翠。湖北直抵幕府山下，那里有皇帝的猎场。经过此湖，既可以泛舟湖上，又能在湖侧纵马射猎，的确使人兴趣盎然。而湖中的绿洲掩映于碧波青山之间，湖南的长堤上遍植垂柳，传说当年梁武帝的昭明太子就在长堤所通的湖中小岛上设别馆，召集当时著名的文士，编纂了《昭明文选》。想来当年的玄武湖上，必定是绵绣满眼，书声朗朗，烟雨濛濛，香荷柄柄，单舸采菱，叠舟采莲，渔歌唱晚，柳浪闻莺，江南水乡的旖旎风光，南朝士人的文采风流，均集于此湖之中。也难怪南朝的帝王们会对此流连忘返，左思《三都赋》中有句：“造姑苏之高台，临四远而特建，带朝夕之浚池，佩长洲之茂苑。”从中也可一窥玄武湖当年的繁盛。
隋灭陈后，将这里的六朝城市宫苑全部拆毁，唯留下一座石头城作为扬州的州治，后来又将其移至广陵。从此，广陵就被称为了扬州。唐代同样也不断降低此地的地位，甚至将此地的两县划归不远的润州（镇江）管辖。但六朝的繁华不是一纸行政命令就可以抹杀的，晚唐时大诗人杜牧到此，依然还看见秦淮河边，红灯绿酒，《后庭花》的歌声还不时传至耳边。唐代几位著名的诗人，李白、杜甫、刘禹锡、李商隐等都到过南京，留下过许多名篇。此时的玄武湖，繁华不再，唯有一潭碧波，留后人凭吊，自然也常常出现在诗人们的笔下。只是，此时的玄武湖更像一面明镜，映照出三百年的兴衰荣辱。
到了五代十国时期，割据江东一带的杨吴与南唐曾在10世纪初三次修筑南京城，名曰江宁府，其规模大于六朝时的建康城，将城南秦淮河一带的居民聚焦区也囊括而来。此城周边有二十余里，在当时亦是大城，一直沿用至明朝。而在唐代一度荒废的玄武湖也再次繁盛起来。宋初郑文宝所撰的《南唐近事》记载与玄武湖有关这样一件事，当时此湖“名园胜境，掩映如画，六朝旧迹，多出其间。每岁菱藕罟网之利，不下数十千”，“一日诸阁老待漏朝堂，语及林泉之事，坐间。冯谧因举元宗（唐玄宗）赐贺监（贺知章）三百里镜湖，信为盛事，又曰：‘予非敢望此，但赐后湖，亦畅予平生也。’”从这段记载我们可以看出玄武湖当年的繁华，但也能发现此湖似乎并没有得到帝王的青睐，否则冯谧又怎会有获此湖的愿望呢？当时徐铉说，“主上尊贤待士，常若不及，岂惜一后湖？所之者知章尔。”暗讽冯谧无知章之才，还有此妄想。南唐的大臣也大都如此，不过是一群书生，舞文弄墨尚可，但于国事无补，只能眼看着国家走向灭亡而束手无策。就在北宋年间，玄武湖遭遇到了一次巨大的浩劫，当时的江宁府尹，名相王安石认为玄武湖空蓄波涛无用，建议泄湖为田，从此玄武湖在南京历史上消失了二百年。王安石的建议也有一个背景，就是玄武湖当时正处于枯水期。玄武湖水本来不深，在六朝时有些地方就是沼泽，故当时帝王造埭以蓄水。此时荒废已久，想来干涸之处更多。不过玄武湖一消失，南京城遇雨既淹的恶梦便挥之不去了。江宁城也将与玄武湖一样，遭遇更大的浩劫。数十年后，靖康之难起，金兵南下，占据江宁。后岳飞在牛首山大破金军，韩世忠也曾困住金人数十天，金兵被迫北返，临走时放起大火。待宋兵进入城中时，满眼断壁残垣，居民也不足原先的十分之一了。南宋时，此地因为是织锦的集散地，也曾恢复了几分繁华，但已不能与前朝相比。至元朝，玄武湖再度恢复，江宁也成了元朝的集庆路，但湖面只及六朝时的三分之一，就如兵火后的江宁城，再也难以恢复当年的繁华。
明太祖朱元璋，起兵后三次攻打南京，最终以此地作为自己一统天下的基地。朱元璋修建的南京城以南唐的江宁府为基础，东面加了一个宫城，北面加了一个方城，直抵长江，当时世界上最大的砖城就此诞生，南京今日的规模也就此出现了。朱元璋使玄武湖进一步缩小，筑太平堤使湖面不再抵达钟山，将湖的一角包入城中，就是今天的西家大塘。玄武湖中的绿洲也被辟为黄册府，保存全国的档案。传说有一位毛姓老人以鼠患多来劝谏他，他反以“毛”“猫”谐音，将不肯迁走的老人淹死，还封他为湖神，希望他能帮自己避免鼠患。这仅是传说，但史上的确记载有一位老人建议黄册府库东西向开窗，使日光早晚曝晒，防止受潮。现在发掘的黄册库遗址的确如此，是东西向开窗的。湖边曾经发掘过一枚铜钩，传说是毛老人的衣钩，于是在那里建成了湖神庙。有明三百年来，玄武湖就成一方禁地，百姓对它只能是可望而不可即了。不过湖中尚有湖民，也有园林，《儒林外史》中就有名士隐居于湖中的记载。在明朝时，因为府库扩建至梁洲，为防火患，就在挖了一条环形水渠将之与外界分隔，这就是今天的环洲。随着明朝灭亡，黄册府库也茫然无存了。
清代玄武湖再度繁盛，因为湖中的水产。当时玄武湖的荷叶供应全城使用，政府甚至颁布了荷叶专卖令，命令全市使用的荷叶只能使用玄武湖中所产。樱洲的樱桃、湖中的水产供应全城使用，城北台城一侧的长堤上依旧密植杨柳。清末名臣曾国藩第一次任两江总督时，又曾疏浚湖面，用湖泥筑堤，将环洲与玄武门联结起来，免除了游人乘船之累。此时，吟诵玄武湖的诗篇已逐渐将描写湖光山色作为主流，以往的兴衰废替的沧桑感渐渐淡了。明后期名臣朱之蕃刻印的《金陵四十景》以“平堤湖水”命名玄武湖，将之列为第十景。当时“洲上置库以貯图籍，禁不得游”，“惟长堤障水，一望荷芰灿烂，香风远来，夹堤高树，坐荫纵观，不能舍去”。此时的玄武湖已给人颇多畅想，清初“金陵八家”之一的高岑绘成《金陵四十景》将后湖（玄武湖别称）列为第二十一景，雕板刻印，比前者更加精美。清代乾隆年间，金陵四十八景形成，“北湖烟柳”被列为第十四景，清末徐上添所编的《金陵四十八景》中称此处“春秋佳日，月夕花晨，或棹扁舟，或短极沼堤，眺望有步步引人入胜之妙”。民国徐寿卿所编的同名书作中称此处与西湖相比“有过之无不及”。民国时期，玄武湖被辟为“五洲公园”，再次成为南京的名胜。
此刻，游人再游此处，诗情画意，历史沧桑，会更多一些吧。
